Modification des peptides

<strong>Figure 5. (a)</strong> Spectre de masse de peptides phytochélatines synthétiques, complexants naturels des métaux dans les plantes.
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<strong>Figure 5. (b)</strong> Spectre de masse et profil HPLC d’un peptide modifié avec la sérine-octanoyl et l’espaceur acide aminohexanoique.
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Notre société a acquis une grande expérience dans la synthèse de peptides difficiles aux structures sophistiquées. Nos peptides sont réputés pour leur grande stabilité et l’excellente activité biologique généralement observée dans de nombreux domaines de recherche.

Peptides cycliques

<strong>Figure 6. (a)</strong> Spectre de masse du précurseur linéaire A et du produit cyclique final B.<br>
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<strong>Figure 6. (b)</strong> Cyclisation de l’extrémité N-amine à l’acide glutamique interne d’un peptide de 27aa contenant 21 aa hydrophobes (masse molaire calculée 2894) préparé (100 mg) avec une pureté >95% . L’analyse d’un échantillon par MALDI-TOF MS montre une perte de H2O (-18 amu) par condensation conduisant au produit désiré avec un ion moéculaire à m/z 2894.0.
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Les peptides cycliques suscitent de plus en plus d’intérêt du fait d’une bonne stabilité chimique et d’une résistance considérablement accrue aux dégradations enzymatiques naturelles. La conformation de ces peptides est plus rigide que celle de leurs analogues linéaires, ce qui pourrait expliquer en partie les accroissements d’activité biologique observés. Nous préparons couramment des peptides par cyclisation tête-à-queue des extrémités amine et carboxylique. La cyclisation par formation dirigée de ponts disulfures intramoléculaires (jusqu’à deux par molécule) est également très courante ; le suivi par spectrométrie de masse de la réaction permet de garantir une cyclisation totale.

Marqueurs et espaceurs

<strong>Figure 7. (a)</strong> Spectre de masse d’un peptide fluorescent contenant un espaceur PEG.
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<strong>Figure 7. (b)</strong> Spectre de masse et profil HPLC d’un peptide cyclique dimérique lié avec un espaceur C6.
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Selon votre application, nous pouvons vous préparer des peptides biotinylés ou fluorescents avec divers espaceurs. Nous proposons des espaceurs C3, C6, C12, C18, ou des dérivés du Polyéthylèneglycol (PEG).

Extrémités des peptides

Nos peptides sont habituellement synthétisés en laissant les extrémités libres i.e. avec les groupes amine et acide carboxylique. 

Mais dans certains cas, il peut être nécessaire de modifier les extrémités. 

Les groupes N-acetyl et C-amide sont souvent utilisés car ils sont électriquement neutres comme la structure interne ; ils améliorent aussi la résistance à la dégradation enzymatique.

<strong>Figure 8.</strong> Spectre de masse d’un peptide de 20aa avec l’extrémité C modifiée par un thioester et comprenant une lysine N-acétylée.
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Extrémité-N (par défaut NH2) Extrémité-C (par défaut COOH)
acetyl, formyl amide
myristoyl, palmitoyl hydroxyl
carboxyl thioester
2-furoyl (…)

Modifications possibles

Genosphere Biotechnologies propose un large éventail de modifications comme indiqué ci-après. De nombreuses autres modifications sont possibles.

<strong>Figure 9. (A)</strong> Analyse MALDI-TOF MS de deux peptides de 20aa (a) Peptide non modifié, masse molaire calculée 2404 et (b) Peptide phosphorylé par deux thréonines ; masse molaire calculée 2564.
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<strong>Figure 9. (B)</strong> Spectre de masse d’un peptide doublement marqué : 7-methoxycoumarine (MCA) et 2,4-dinitrophenyl (DNP) lié par les groupements ε-amine de lysine.
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Acides aminés spéciaux Modifications chimiques
Enantiomères D Phosphorylation : Tyr, Ser, Thr
Hydroxyproline Biotin, DNP
Pyroglutamine Aniline C-terminal
Methyl-, acetyl-lys Benzyloxycarbonylation
4-Bromo-, 4-Nitro-phe Nitrosation
β-alanine N-Methylation
Marquage fluorescent Couplage macromoleculaire
Coumarine Acides gras
Fluorescéine Protéines
Rhodamine Cyclisation
DANSYL Pont di-sulfure cys-cys
NBD Cycle tête-à-queue
DABCYL Lactame, interne

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