El método de degradación de Edman comprende las etapas sucesivas siguientes (i) formación de un derivado del extremo N de la proteína por reacción del grupo amino terminal libre con fenil isotiocianato (PITC), (ii) corte del aminoácido modificado y (iii) análisis por HPLC en fase inversa con detección UV a 270 nm. 

La comparación de los tiempos de retención obtenidos con los de una muestra estándar de aminoácidos derivados permite identificar la secuencia.