Séquençage par la technique de dégradation d’Edman
Les peptides et les protéines dont l’extrémité N est bloquée (e.g. groupe amine avec un dérivé acétyl, formyl….) ne peuvent pas être séquencés par cette méthode.
Les protéines de haut poids moléculaire ( > 75 kDa) se révèlent souvent difficiles à analyser. La raison en est, la plupart du temps, une quantité et/ou qualité insuffisantes de l’échantillon. Dans ce cas, merci de nous contacter avant de nous envoyer votre échantillon.
Les Cys non modifiés et les résidus glycosylés donnent un cycle blanc (i.e. l’acide aminé est bien clivé de la chaîne peptidique mais n’est pas détecté par HPLC à 270 nm)
La qualité de l’échantillon est cruciale. La présence de toute impureté pouvant intervenir dans les réactions chimiques en jeu (en particulier les espèces contenant un groupement amine) rendra l’analyse impraticable.